能力是等級5的發電系能力「電擊使（Electro Master）」[g]。
她是學園都市所有發電能力者裡等級最高者，能力強度也較其他同能力者強很多。如同後面文字的敘述，她可以靈活運用她的能力來進行各式各樣的攻擊。因本人具有發電能力，因此一般的電擊器對她並沒有影響[10]，但是過強的電擊還是會造成傷害。
基本上放出電擊攻擊的速度、準確度都非常好。作品中出現的投擲出去的高壓電流稱為「雷擊之槍」，能夠使出的極限電壓為10億伏特。她同時也可以召喚出真正的落雷。御坂美琴在学院都市七位超能力者（Level 5）中排第3位，與第4位原子崩壞（麥野沉利）能力互相克制。两人能够互相扭曲对方的攻击。
發出的電力能夠驅動戰艦[11]。
超電磁砲
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参见：磁軌砲
這可以說是美琴能力的代名詞，同時也是她的絕招之一。
超電磁砲，在現實中包括了線圈砲以及磁軌砲等。就是利用超強的電磁鐵，將導體製成的砲彈打出去的武器，在現實中一般用在戰艦上，優點是威力大、射程遠、精度高且成本小。
在《科學超電磁砲》和《魔法禁書目錄》中，御坂美琴的的外號叫做「超電磁砲」，其英文名稱「Railgun」，中文也可翻成「磁軌砲」的意思。
她主要是以遊樂場代幣作為子彈，先將代幣放在自己的拇指上，再配合自身產生的電力集中於拇指前端，將這些電能轉換成大量的動能發射出去。在發射後御坂美琴能不斷用電磁力修正發射軌道和出力。產生出的大量動能讓發射出去的代幣以三倍音速[h]彈擲出去，其攻撃力、貫穿力極高，位在射程彈道上的雜物會全部清除掉，直徑2公尺的電流造成的等離子煙霧以及爆風也會造成相當大的衝擊波。
缺點是射出去後所造成的熱摩擦會使代幣熔化，因此只能達到約50公尺的射程。但若改變子彈的質量，就能增加威力以及射程。[i]
雖然能夠藉由改變子彈的質量來增加攻擊力以及射程，但若是射出去的子彈太重[j]，會無法以三倍音速射出，不過即使速度減少，其所造成的攻擊力還是不容小覷。
後來搭載的對魔法驅動铠可以射出要塞攻略級别口徑的超級電磁炮。
在外傳小說《某自動販賣機的存在證明》中，超能力者的第7位削板軍霸用嘴接住了御坂美琴使出三成實力的超電磁炮。
在魔法禁書目錄PSP遊戲中和另一位能力者合作放出「超巨大超電磁炮」。
在與春暖嬉美的交戰中，通過發射大型金屬塊打出了類似“散射超電磁砲”的攻擊。
液状被膜超電磁砲（リキッドプルーフレールガン）
美琴的超級電磁炮在食蜂的支持下以合力狀態使用A.A.A。 附著在硬幣表面的少量水帶走了子彈的熱量並促進了冷卻，同時爆炸性地像蒸汽一樣膨脹，甚至在發射後仍加速超過初始速度。 這是一種只能通過“心理掌握”進行精確液壓操縱才能執行的技術。 它的力量足以在“無窗建築”中打出一個大洞，即使在第一次旋轉中只受到一次打擊也沒有損壞。
應用
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美琴能夠操縱電力，因此根據馬克士威電磁定律，美琴所產生出的電流能夠產生磁場。因此這項能力的副產物就是能夠操縱磁力，所操縱的磁力能牽動附近任何含鐵、鎳、鈷的物質。根據操縱磁力的方式不同，也可以將含鐵的物質牽引來製作出防禦對手攻擊的盾，利用含鐵的建材以及瓦礫也可以
製作出立足點與多種應用（例如能夠利用磁力吸引建築物裡的鋼筋藉此在牆上移動）。產生出的磁力更可以操作地表中的鐵砂，製成可以切斷任何物體的振動劍。另外，美琴曾說，比起操縱暖暖包中的鐵粉，她更喜歡操縱地表中的鐵砂。[12]如果在周圍都是良導體的環境內，甚至可以操縱磁力懸浮在空中。
也可以直接用電氣信號、電子來操作電子機械來進行駭客的行為。此外，也能用電磁關連的知覺能力來測得磁力、也能使用AIM擴散力場的能力，察覺周遭反射過來的微弱電波來得知周遭的事。「超電磁砲」的電氣信號也是偶然間窺視進木山春生的腦袋裡來讀取她的回憶。同時具有自然形成的「電磁屏障」，可以抵抗對精神的外力入侵，因為精神力說穿了就是一系列的腦部電氣信號，因此強如「心理掌握」食蜂操祈的精神操控力都只能對她造成瞬間的精神衝擊，而無法控制她的心智。御坂美琴甚至能用直接干涉自己身體的生物电縱經系统，在科學超電磁砲中直接用電磁力操縱被麻痺的身體（雖然這樣很痛），而且可以用生物電流強化肌肉，拳力可達325千克。
其它還有，可以利用電磁誘導加熱的原理來使物體加熱。
在某些限定的狀態下，也可以利用電磁加速的方式來增加物體的移動速度，甚至可以利用電磁在空中飛行。
第四位超能力者原子崩壞的能力破壞力在御坂美琴之上，但是由于御坂美琴能力的極大實用性和多用性，她可以在超能力者中排第三位。
美琴的輸出電壓最高可以達到十億伏特，但是，根据電學原理，她的招式輸出的電流其實並不高，除非身處周圍都是良導體的環境，否則由於空氣和地面的巨大電阻，電流會低得嚇人。
另外由於鐵砂所產生的武器並沒有形狀的限制，因此能夠將鐵砂自由變成自己想要的形狀。在原作中曾將鐵砂之劍轉變成鞭狀來攻擊遠處的敵人，也能形成長槍狀刺穿目標，更能操縱空氣中飄舞的鐵砂形成龍捲風狀團團包圍住敵人將其切碎。
其他能力
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鐵砂之劍（砂鉄の剣）
根據美琴產生出的磁力來操縱地表中的鐵砂，受磁力操縱的鐵砂會形成一把振動之劍，能夠切開任何物質，猶如電動鏈鋸一般地切斬目標。
鐵粉彈丸
目前僅於《科学超电磁炮SS2》出現的能力。將美琴產生出的磁力來操縱暖暖包中的鐵粉，受磁力操縱的鐵粉形成猶如彈丸般的小圓球狀，射向目標的武器(例如槍口或是裝彈口)，來達到破壞對手槍械內部機關的目的。
水之翼
目前僅於《科学超电磁炮SS》出現的能力。由於對手的魔法攻擊所產生出的高熱光線襲向了海面，因此讓大量的海水被蒸發，產生出了極大量的水蒸氣。這些水蒸氣是由變成粒子狀的水分子飄散在空氣之中的，而這些細小的粒子之間存在著微弱的聯繫，也就是靜電。
因此美琴重新控制電力發射的方向，將漂浮在空氣之中的大量水分子一口氣抓到自己周圍，並以制造鐵砂之劍的計算公式為基礎，再替換掉關鍵的數值和符號，重新計算出利用靜電控制空氣中水分子的公式。將以光線攻擊為中心的周圍直徑一公里以內的所有水分子全部集中到她的身邊。
將這些漂浮在空氣中的水分子作為連接電力和海水之間的觸媒。並將這些水分子集中在背後爆炸，噴出兩道青藍色的光芒，形成一對光之水翼，藉由這些薄如刀鋒一般的水分子組成的翅膀來提供美琴向上昇的浮力，噴射所產生的能量還能夠作為前進的動力。
雖然常理來說只要幾秒鐘便會蒸發殆盡的水蒸氣，但由於美琴身處大海，無止盡的海水能夠做無限的補給所以可以支撐很長時間。
因此美琴雖然成功漂浮，但是最重要的平衡性卻無法掌握，所以美琴在背後增加了兩對比較短的翅膀。再重新調整了水噴射的流量以及空氣的平衡性之後，才終於能夠穩穩地飛在空中。
另外，為了保持水之翼的燃料供應，在海面上伸出一個好像巨大的人類手腕一樣的水柱連接到美琴的背後跟隨。
這招的缺點是只要周圍的水蒸氣蒸發了水之翼就會消失，美琴也會從半空中墜落。
雷擊之槍（雷撃の槍）
最后的落雷
於《科学超电磁炮》和《魔法禁书目录》中都出現的招式，召喚巨大的雷雲劈下，釋放出巨大的電流，最高輸出電壓为十億伏特，威力非常巨大，可以說是御坂美琴的必殺技。
雷巨人モード
弱點
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如果持續使用能力，會造成無法全面性使用能力的窘境。雖然本人說是「我沒電了」，但只要適當的休息，能力就能恢復。
另外由於本身以及其复制人群体“妹妹们”都會釋放出微弱的電磁波，因此動物都不太接近她，這似乎讓美琴非常沮喪。
如果出现可以吸收电流的能力者，会完全克制御坂美琴的能力。
PHASE-NEXT
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大霸星祭篇被木原幻生施以強制迫近絕對能力者狀態的實驗。然而幻生預期，穩定達到那樣的狀態是不可能的，在完成度53%左右人格就會異化為不同次元的東西，成為絕對能力者的瞬間身心將到達極限而死亡。而且無論結果成功還是失敗，都會以發足以摧毀學園都市的大爆炸。
第一階段（Phase 5.1）頭髮倒豎，頭上2個卷角形成如裹覆羽衣的雷神一樣的身姿。電磁力遠比平常強勁，僅僅2%的完成率也能引發足以將無窗大樓整個吞噬的巨大落雷。
第二階段（Phase 5.2）角合在一起形成第三隻眼，身旁壓縮的能源塊形成翅翼。
第三階段（Phase 5.3）角從頭部分離，形成像天使一樣的光環，肩膀以上被黑暗的陰影所覆蓋。到達這個狀態的話，將能從異次元喚來能量。
在达到此状态后被上条当麻和超能力者第七位削板军霸合力恢复到正常形态（但是恢复的时候是裸体，《某科学的超电磁炮T》动漫中上条当麻将自己的外衣披在御坂美琴身上）。
A.A.A.（對魔法用驅動鎧 Anti-Art Attachment）
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在《新约 魔法禁书目录》第十三卷，坐着上条当麻的自行车和他一起逃避魔神僧正的追击，被僧正说是当麻的累赘而十分失落。在新约第十五卷末尾，意识到自己的超能力在魔法世界是微不足道的御坂美琴，意外在一个巨大的武器仓库内找到了一套机械装备。为了追上上条当麻的脚步，毅然决定穿上了这套装备，可以操纵A.A.A.进行各种战术动作，在新约第十六卷对抗element的战斗中发挥了巨大的作用。但是也因此被学院理事长亚雷斯塔盯上，因为A.A.A.是他的神装。